酶标仪主要应用于生物教学、科研、实验等领域。适合微生物、动植物、食品检验等实验分析，也非常适合基层医院临床检测使用。酶标仪检测自动化，智能化，适合批量样品数据检测。人机交互性能好。操作使用简便。精度高，稳定度好，特别适合低刻度、小剂量的分子生物领域检测使用。
酶标仪是医院检验科常用的一种医疗器械，它主要是用来对酶联免疫反应等进行检测，并对实验结果进行读取和分析，这样可以诊断出人体的酶健康状况。对于酶标仪这类专业的医疗器械，其不仅仅用于医院检验科，而其可以通过偶联在抗原或抗体上的酶催化显色底物进行的，反应结果以颜色显示，通过显色的深浅即吸光度值的大小就可以判断标本中待测抗体或抗原的浓度，这一功能已经成熟应用于我国的疾控中心。
在食品安全领域，酶标仪的应用也很广泛，例如它可以检测奶粉中的三聚氰胺、可以检测猪肉中的瘦肉精等，可以检测粮食里的真菌毒素等，从而确保食品安全，保证人民群众的身体健康。那么国家对于酶标仪生产厂家是如何要求的呢？我们应该仔细甄选适合自己的酶标仪产品。国内多家机构，如卫生部临床检验中心和计划生育系统等多次强调酶标仪的重要性，并要求酶联免疫检测试剂应使用全自动酶标仪判读，酶免试剂的质控也应使用酶标仪，并提供酶标仪测定的原始数据。
